近日,全球首款油菜液相育种芯片在西南大学研发成功,标志着我国种质资源研究再次获得新突破。这款芯片,将为油菜育种提供有效的基因组学资源。
这款油菜液相育种芯片,由西南大学农学与生物科技学院李加纳、卢坤教授团队历经8年研发而成,它是一种液态的反应和检测体系,相比于之前的油菜育种芯片,精准性得到了几何级数的提升。
西南大学农学与生物科技学院教授、博士生导师,油菜50K液相育种芯片研发团队负责人卢坤介绍,传统的固相芯片是基于荧光检测,而液相芯片是基于DNA的捕获、测序,能够针对同一个位点进行上百次的检测。由于固相芯片只检测一次,所以液相芯片的准确性要比固相芯片高很多,同时成本也可以降低到固相芯片的十分之一到五分之一。
研发团队目前已对全球588份有代表性的油菜品种进行了全基因组重测序,验证了该芯片能够在油菜的靶向捕获测序、遗传分析和育种等方面提供有效的基因组学资源。目前,该成果已在国际学术期刊上发表,成为全球首款油菜液相育种芯片,为我国的种质资源研究又增添了一抹亮色。
卢坤表示,液相芯片的使用,便于他们开展基因组设计育种工作,也就是可以设计今后品种的基因组,并且还可以利用育种芯片对品种进行监测,最终能够精确实现品种的培育。